“一直以来，司令部的任务对我们国家至关重要。高度的专业、执著的团体精神和责任感使得MSC成为二十一世纪的优秀团队。我们不仅服务于美国，也致力 于服务美国在全世界的海上利益。”司令部指挥官莱利在部门主页上的话，清楚反映了该部门的任务和目标。此次事件的主角“无瑕”号就隶属于这一司令部。
海上补给司令部的船只由平民人员操控，他们称自己是“服务中”，而不是“服现役”。其中一些船只归美国政府所有，这些船只名称拥有“USNS”前缀，表示是美国海军船只，其他一些是包租商船，前缀仅有“MV”或是“SS”。
海上补给司令部有四大任务：海上补给、海军补给舰队、特别使命和先行定位。海上补给任务主要提供大 部分的供给运输任务，通过油轮进行燃料传输，利用货轮传输设备、仪器、直升机、弹药和物资；海军补给舰队的角色是直接对正在执行任务的船只进行补给，让它 们不用靠岸就可以继续作业；特别使命则是操控船只进行特别的军事或联邦政府的任务，例如潜艇支持和导弹飞行数据收集和追踪；先行定位负责支持美国军事存在 的扩张，在关键海域提前派遣供给船只。
“无瑕”号是执行海上补给司令部的特别使命项目。该项目拥有25艘船只，负责向美国军方和其他政府 项目提供操作平台和有关服务，具体包括海洋和水道测量、水下监视、导弹追踪、声呐侦察、控制指挥、潜艇和特种战斗支持等。这25艘船只提供服务的对象范围 颇广，包括：美国舰队司令部，海军海洋学部门、水下监视指挥部、美国空军、海军海上系统司令部、海军战略系统项目办公室、海军特种战斗司令部、海军设施指 挥部、美国环境保护局，以及潜艇部队。
大多数特别使命项目的船只，都是由与海上补给司令部签有合同的私营公司雇佣平民海员控制。只有“艾莫里·兰德”号、“惠特尼山”号以及“宙斯”号由海上补给司令部的文职海员操控。
目前，海上补给司令部在全世界有超过9000名工作人员，80%在海上作业。总部位于华盛顿特区的海军工厂，在全世界有6个分支。
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